Em 26 de março de 1991 no Paraguai, os Presidentes da Argentina, Brasil, Paraguai e Uruguay assinam o "Tratado de Assunçao" para a constituçao de um Mercado Comum entre os quatro países, denominado MERCOSUL.

Em 17 de dezembro de 1996, em Fortaleza, Brasil, o MERCOSUL e a República Oriental do Uruguai assinam o acordo sede, com o objetivo de estabelecer as modalidades que facilitarâo o desempenho das funções da Secretaria e de seus funcionarios. Em seguida, a Prefeitura de Montevidéu cede o uso do primeiro andar do Parque Hotel e se iniciam as obras de remodelação, recuperação do salão de refeições em Sala dos Presidentes e o ex salão de festas em Sala de Plenarios.

Em 15 de dezembro de 1997, na ocasião da XIII Reunião do Conselho dos Presidentes, foi inaugurado o que então passou a se chamar "Edificio MERCOSUL"

Desde dezembro de 1998, quendo foram finalizadas as obras de remodelação e, ao ser assinado no Río de Janeiro o Acordo o MERCOSUL e o Uruguai, a Secretaria Administrativa do MERCOSUL funciona definitivamente no primeiro andar do "Edificio MERCOSUL" (antes Parque Hotel) no Parque Rodó, em frente a Praia Ramírez.

A Secretaria Administrativa do MERCOSUL é o órgão de apoio operativo do MERCOSUL, responsable pela prestação de serviços aos órgãos da estrutura institucional do MERCOSUL e tem sede permanente em Montevidéu.

As funções e atribuições da SAM são variadas e orientadas a prestar apoio ao funcionamento dos Örgãos da Estrutura Institucional do MERCOSUL, especialmente aos de caráter decisorio: Conselho do Mercado Comum, Grupo Mercado Comum e Comissão de Comércio do MERCOSUL.

O Director de SAM é eleito pelo Grupo Mercado Comum e designado pelo Conselho do Mercado Comum, fato que ocurreu em 15 de dezembro de 2000, na cidade de Florianópolis, onde foi nomeado Diretor da SAM o Licenciado Santiago González Cravino, para ocupar o cargo de 1° de janeiro de 2001 até 31 de dezembro de 2002, não podendo ser reeleito, segundo o estabelecido no Art. 33 do Protocolo de Ouro Preto.

A SAM orgánicamente está dividida em quatro Setores: Documentação u Divulgação, Normativa, Administração e Informática, exercendo a chefia de cada um destes Setores, um nacional de cada um dos Estados Partes.

Entre as atividades desempenhadas pela SAM, podem-se assinalar as seguintes:

• Servir de arquivo oficial da documentação do MERCOSUL.
• Realizar a publicação e a divulgação das normas adotadas no marco do MERCOSUL.
• Editar o Boletím Oficial do MERCOSUL, publicação trimestral prevista no Protocolo de Ouro Preto, que contém a normativa do MERCOSUL, nos idiomas espanhol e portugués.
• Informar aos Estados Partes sobre as medidas implementadas em cada país para incorporar no seu ordenamento jurídico as normas emanadas dos "Órgãos do MERCOSUL.
• Registrar as listas nacionales dos árbitros e especialistas do sistema de Solução de Controversias e apoiar aos Tribunales Ad. Hoc, previstas no Protocolo de Brasilia, os quais deverão deliberar sobre as controversias que posma surgir entre os Estados Partes por motivo da aplicação ou interpretação da normativa do MERCOSUL.
• Apoiar as reuniões dos Órgãos do MERCOSUL.
• Confeccionar e manter atualizadada a página Web do MERCOSUL, cuja direção eletrônica é: www.mercosul.org.uy